Tätigkeit am IfN
Algorithmische Auswertung von 3D Mikroskopiedaten
In der Forschungsgruppe Molekulare Physiologie am Leibniz-Institut für Neurobiologie (IfN), untersuchen wir den Einfluss ausgewählter Moleküle auf die Wahrscheinlichkeit einer erfolgreichen Signalübertragung zwischen zwei Nervenzellen. Dazu binden wir fluoreszierende Nanopartikel an die gewünschten Moleküle und mittels Fluoreszenzmikroskopie können wir die Nanopartikel aufnehmen und somit indirekt Aussagen über die eigentlichen Moleküle treffen.
Links: Unser Mikroskopiesetup, Mitte: 2D Mikroskopieaufnahmen, Rechts: Graphisch aufbereiteter 3D Stack von einzelnen Mikroskopieaufnahmen. Zu sehen sind ein Partikel (rot), seine bisherige Trajektorie (blau) sowie die markierten Synapsen (grün), zwischen denen sich der Partikel bewegt.
In diesem interdisziplinären Umfeld zwischen Informatik und Neurobiologie ergeben sich diverse Aufgabenstellungen wie z.B. Programmierung von Auswertungsverfahren der Mikroskopiedaten, Bewegungsanalyse der 3D Trajektorien oder Matlab GUI-Programmierung.
Aufgrund des Umfangs der Thematik, sind wir eher an längerfristigem Engagement interessiert und können dann natürlich auch interessante Laborpraktika oder Abschlussarbeiten anbieten. Alle Aufgaben stimmen wir auf jeden Fall gerne mit deinen Interessen ab.
Ansprechpartner: Stefan Sokoll